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“超级生命计算机”——全球日生产能力最强基因测序仪在深发布

   日期:2019-05-17     浏览:5    评论:0    
核心提示:  2018年10月25日,全球最具影响力的集基因组学研究和产业应用于一体的国际交流峰会第十三届国际基因组学大会(International

  2018年10月25日,全球最具影响力的集基因组学研究和产业应用于一体的国际交流峰会——第十三届国际基因组学大会(International Conference on Genomics,以下简称“ICG-13”)在深圳举行。

  开幕式上,“超级生命计算机” ——MGISEQ-T7的发布引人注目,这台由华大集团旗下子公司——华大智造自主研发的最新超高通量的基因测序仪一天就可以完成60例个人全基因组测序,日产出数据高达6Tb,是目前全球日生产能力最强的基因测序仪。

  基因是生命的密码,国家级人群基因组学研究以及对遗传资源的保护与应用是精准医学的基础,直接影响到一个国家在生物医药领域的核心竞争力。因此,自国际人类基因组计划之后,各国纷纷推出国家级大规模人群基因组测序项目。

  近日,华大在国际权威学术杂志《细胞》上发布了最大规模中国人基因组学大数据研究成果,这标志着我国已迈出“百万人群基因大数据研究”的重要一步。几乎同一时间,英国政府再次宣布将在未来五年内开展500万人基因组计划。

  然而,由于受到设备数量、速度和成本等现实原因的制约,基因组的测序效率在前几年推进并不顺利。以英国为例,2012年12月,英国启动十万人基因组计划,一直到2018年7月,花了5年半的时间才完成7万多例全基因组测序。

  据了解,本次发布的全新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”,将彻底改变目前现状。日产出数据高达6Tb,意味着一天就可以完成60例个人全基因组测序。以前,十万人级别的基因组测序可能需要4到6年的时间才能完成,现在,仅需6台该测序仪,一年时间即可完成,这将对目前测序产业的发展起到强有力的推动作用,也标志着基于基因检测的精准医学研究全面进入大数据时代成为可能。

  目前,市场上所有的测序仪最多只能支持两张芯片同时运行,而T7的4联芯片平台采用独特的芯片搭载技术,可实现4张芯片进行完全独立的测序流程,如同4台测序仪同时进行工作,且芯片间互不影响。

  同时,MGISEQ-T7可同时支持全基因组测序、超深度外显子测序、表观基因组测序、肿瘤大Panel基因检测。也就是说,用户可以按照他们的不同需求随时随地进行同时测序,并可以最大程度节省时间。

  测序仪运行速度的快慢将直接影响到测序项目的交付时间,因此,业界始终致力于提升测序仪的运行速度。研发团队通过全面升级生化系统、光学系统,并将图像数据处理速度提升15倍,从而使得MGISEQ-T7测序速度提升到行业最高水平的50%以上,远远领先于其他测序仪,仅需不到24小时便可完成PE150。

  据了解,测序仪芯片密度越高,意味着可产出更多的有效数据量。MGISEQ-T7将原有的芯片密度提高了20%,使得单张芯片即可实现Tb级数据产出。加之4张芯片可同时独立运行,24小时无休轮转,MGISEQ-T7每天最多可产出6Tb数据,真正实现强大日生产能力。

  此外,针对基因测序特殊的要求,华大智造研发出自动化样本制备系统MGISP-960,单次最多可自动完成96个样本的制备,支撑了MGISEQ-T7测序通量需求,让MGISEQ-T7的强大性能得以更充分的体现。

  与此同时,华大智造还将在ICG-13的同期卫星会上发布最新建库技术stLFR和生信分析加速产品MegaBOLT。例如肿瘤数据的分析较常规数据更为耗时,而使用MegaBOLT,可以带来15倍以上计算速度的提升,从源头上大幅促进肿瘤研究的进程。同时,MegaBOLT也将上线BGI Online云计算平台,为接下来的基因数据的分析提供了更加灵活高效的解决方案。(光明融媒体记者 党文婷)

  5月15日,亚洲文化嘉年华活动在北京“鸟巢”举行。新华社记者 张玉薇 摄5月15日,亚洲文化嘉年华活动在北京“鸟巢”举行。新华社记者 王毓国 摄5月15日,亚洲文化嘉年华活动在北京“鸟巢”举行。

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  当日,《焦裕禄之歌》——纪念焦裕禄同志逝世55周年专题音乐会在河南省开封市举办。当日,《焦裕禄之歌》——纪念焦裕禄同志逝世55周年专题音乐会在河南省开封市举办。当日,《焦裕禄之歌》——纪念焦裕禄同志逝世55周年专题音乐会在河南省开封市举办。

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